澎湖县（90）
澎湖群岛
马公市（7）
澎湖本岛
中央屿（大央屿）、四角屿、鸡笼屿、桶盘屿、虎井屿。（原测天岛因填海造陆，已并入澎湖本岛）
湖西乡（10）
锭钩屿、鸡善屿、查埔屿、查母屿、香炉屿、番薯仔尾屿、赤屿、溪塭、鼓架屿、雁情屿。（备注：不含澎湖本岛；锭钩屿由4座岛礁组成，官方地籍册合称一座岛屿）
白沙乡（37）
白沙岛、目斗屿、吉贝屿
过屿、姑婆屿、铁砧屿、险礁屿、土地公屿、大白沙屿、金屿、屈爪屿、毛司屿、北礁、白沙屿、毛常屿、南面挂屿、鸟屿、员贝屿、小龙（旧名草屿或草屿1）、鸡头屿、坪屿、草屿1（位于瓦硐，旧名草屿2）、大礁、大仓屿、中屯岛、小屿、小屈爪、澎澎滩、流回礁、大硗屿、龙头礁、顺风礁、白贼屿、小列屿、印仔、二硗礁、半年礁。
西屿乡（3）
渔翁岛
小门屿、西公滩（海墘屿）
望安乡（32）
望安岛、花屿、大猫屿、小猫屿
狗沙仔、金瓜仔礁、将军澳屿、船帆屿、后袋仔、马鞍山屿、草屿2（位于花屿）、头巾、西屿坪屿、二塭、东屿坪屿、西吉屿、锄头屿、东吉屿、钟仔、船后礁、天台山塭、笼塭、凹门礁、北塭、白沙塭、南塭、铁砧、香炉、柴埯塭、猪母礁、大塭、酒瓮礁。
七美乡（1）
七美屿（又称大屿）
金门县（14，备注：仅列出官方地籍册之岛屿，不含三胆等岛礁。）
金门岛（1）
金城镇（2）
东碇、建功屿
金湖镇（1）
北碇
金沙镇（2）
后屿、草屿
烈屿乡（6）
小金门（又称烈屿）、大胆、二胆、猛虎屿、复兴屿、狮屿
乌丘乡（2）
大丘、小丘（合称乌丘）
连江县（36）
马祖列岛
南竿乡（5）
南竿岛
黄官屿、浏泉礁、北泉礁、鞋礁
北竿乡（17）
北竿岛
大丘、小丘
高登岛、中岛、白庙、老鼠
铁尖岛、无名岛
进屿、三连屿、峭头（狮屿）
龟岛（位于芹壁外海）、鹊石、蛤蜊
螺山、蚌山
东引乡（7）
东引岛
西引岛
亮岛
北固礁
浪岩（又称小纱）、南引（又称东沙岛、大纱）、双子礁
莒光乡（7）
东莒（旧称东犬）
西莒（旧称西犬）
永留屿
林拗屿、犀牛屿、大屿、蛇山
