鞭毛是所有弧菌、螺菌，约半数的杆菌和极少数球菌的菌体上附着细长呈弯曲的丝状物，是细菌的特殊结构，对宿主有侵害作用。
它由鞭毛素组成，鞭毛素是一种特殊蛋白质，其氨基酸组成与横纹肌蛋白相似，赋予鞭毛一张一弛地波浪运动，推动菌体前进。鞭毛素起始于细胞膜和细胞壁内的基础小体。革兰阳性菌与阴性菌的基础小体不同，因为两者细胞壁的构造不同。
革兰阴性菌鞭毛的基础小体由一根圆柱和套在上面的两对同心圆环组成，附着于细胞膜的一对M环和S环，链接着肽聚糖层和脂多糖层的是一对是P环和L环，但革兰阳性菌的细胞膜没有外膜，故基础小体只有M环和S环。
