口索动物就是半索动物，脊索动物包括头索动物和尾索动物和脊椎动物，尾索动物和头索动物合称原索动物。
半索动物：因其口索曾被认为是短而原始的脊索而得名。主要特征是口索，鳃裂和前段有小腔的背神经索，典型代表是肠鳃纲的柱头虫。
尾索动物：脊索在尾部，变态后随着幼体尾部消失，脊索消失，背神经管退化成神经节，鳃裂仍存在。因成体具被囊，又称为被囊动物。典型代表是海鞘。
头索动物：终生具有发达的脊索，背神经管，鳃裂，肛后尾等典型脊索动物的特征性结构，在原索动物中较为高级。脊索贯穿全身，一直达神经管的前方，故称头索动物。典型代表是文昌鱼
