先将收集起来的人畜禽粪便和按配比要求均匀掺入甲烷菌种、腐熟剂，装入坑内，密封。
此时，因发酵释放的热量，使发酵原料温度提高，在加上腐熟剂的作用，发酵原料温度越高发酵越快，约10天发酵完毕。
发酵原料发酵完毕后，用污水泵持续或间断地把有机废水抽到厌氧发酵池底部的分流器，分流器将有机废水均匀地分流到厌氧发酵池内，有机废水上升，从溢流管溢流到储存池，储存，用于农田灌溉，零排放。
有机废水在厌氧发酵池里上升过程中，与甲烷菌接触，甲烷菌吃了有机废水里的营养物，长身体，繁殖后代。
培养富集甲烷菌种约10天，培养富集好的甲烷菌种出池密封储存待用。
