淮河流经江苏省的洪泽湖、高邮湖宝应湖
洪泽湖是淮河流域中最大的湖泊，它承转淮河上中游约16万平方公里的来水，在12.5米水位时，水面面积2069平方公结里、蓄水量31亿立方米，是中国四大淡水湖之一。是一个集调节淮河洪水，供给农田灌溉、航运、工业和生活用水于一体，并合发电、水产养殖等综合利用的湖泊。设计洪水位16.0米，校核洪水位17.0米，校核洪水位时相应容量为135亿立方米。
高邮湖又称璧瓦湖，是中国江苏省第三大湖。水域总面积为760.67平方公里，水位5.55米时，水面积648平方公里、苇滩和堤坝面积112.67平方公里。高邮湖在高邮市境内水域面积392.82平方公里占高邮湖总水域面积的55.32%。高邮湖属浅水型湖泊，为淮河入江水道整治工程。高邮湖又称璧瓦湖，水面宽广，环境优美，物产丰富。高邮湖蟹是著名的品种之一，鱼虾的产量也很大。
宝应湖位于盐（城）金（湖）公路西不远处,属浅水、封闭型湖泊。据明代《隆庆县志》载：“清水湖在县南，东西长十二里，南北阔十八里，西南连汜光湖；汜光湖在县西南十五里，东西长三十里，南北阔十里，南会津湖，西通洒火湖；洒火湖在县西南四十里，西通衡阳河，东北入汜光湖；津湖在县南六十里，东通大运河，西北会汜光湖。清水、汜光、洒火、津湖汇合为一，人称宝应湖。”随着地理的变化和区划的调整，如今的宝应湖南连高邮湖，西接金湖县，北会白马湖，总面积约140平方公里，分属宝应、金湖两县管辖
