第一次生物大灭绝发生于4.4亿年前的奥陶纪末期，又称奥陶纪生物大灭绝，此次灭绝事件导致约85%的物种灭绝。这个时候海洋生物十分繁盛，这一点很好理解，要知道水是生命之源，地球最早的生命就是诞生于海洋，而陆地生物也是由海洋生物演化而来。
那么此次导致生物大灭绝的原因是什么呢？古生物学家认为是是由于全球气候变冷千万的，大约4.4亿年前，撒哈拉沙漠现在所在的地方是在南极，当它靠近南极的时候，很容易形成厚厚的冰层，就像奥陶纪时期一样。大冰川冷却洋流和大气环流。整个地球的温度下降了，冰川锁住了水，海平面也下降了。
这种情况就是我们现在所说的冰河时期，而且还是大冰河时期，小冰河时期持续时间往往只有几十年，影响是有限的。可大冰河时期就不同了，它让地球的温度更低，而且持续时间漫长，有可能达到千万年之久。因此每一次的大冰河时期的发生，都是生物面临巨大灾难的时候。
第二次生物大灭绝发生于3.65亿年前的泥盆纪晚期，又称泥盆纪大灭绝，这个时期的陆地面积开始不断扩大，陆地生物也开始大量出现进化发展，特别是脊椎动物迎来了飞速发展的时期，爬行动物也开始出现。此次灭绝事件导致地球70%的物种灭绝消失。
第二次生物大灭绝事件主要影响的依然是海洋生物，陆地上的植物和动物反而影响要小得多，这次灭绝事件之后，陆地生物真正迎来了高速发展时期。导致此次灭绝事件的原因现在还不清楚，有科学家认为是全球气候的急剧变化导致的，也有科学家认为是小行星撞击带来的超级火山爆发。
第三次生物大灭绝发生于距今2.5亿年前的二叠纪末期，又称二叠纪生物大灭绝，这是有史以来最严重的大灭绝事件。如果要问五次生物大灭绝事件，哪一次最严重，那一定是第三次无疑了。据统计，这次灭绝事件导致生物科的数量减少了52%，物种的数量减少了90%以上。对海洋生物的影响最大，96%的海洋物种灭绝，导致占据海洋近3亿年的主要生物数量减少和消失，其中包括三叶虫。
在陆地上，超过四分之三的脊椎动物消失了，蜥蜴、两栖动物和兽脚类急剧减少。导致此次大灭绝的原因，科学家认为可能是地球曾经发生海平面下降和大陆漂移，这时候所有的大陆聚集成了一个联合的古陆，很多生物失去了生存空间，而且大气层中的氧气也急剧减少，板块运动造成了气候突变、导致沙漠范围扩大和大规模火山爆发等现象。
也有科学家认为这次生物大灭绝可能和超新星爆发产生的伽马射线暴照射地球有关，比如这一时期大气层中
