如果厂房建在居民区，需要按照国家和地方相关法律法规进行处理。具体来说，可以参考以下步骤：
调查厂房是否符合规划要求：如果厂房建设未取得规划许可或违反规划要求，那么应当按照相关程序进行整改或拆除。
调查厂房是否符合环保要求：如果厂房对周边环境造成污染，应当按照相关程序进行治理或关闭。
调查厂房的安全性：如果厂房存在安全隐患，应当按照相关程序进行整改或拆除。
与居民进行协商：如果居民对厂房的存在有异议，应当与居民进行协商，尽可能地解决居民的合理诉求。
采取必要的措施：如果协商无果，或者厂房存在严重违规行为，可以采取必要的措施，如查封、拆除等。
总之，对于厂房建在居民区的情况，需要依法依规进行处理，同时也要充分考虑居民的利益和安全。
