微生物(microorganism)是指包括细菌、病毒、真菌、原虫等在内的一大类生物群体。通常它们个体非常微小, 肉眼看不到或看不清楚, 需要借助显微镜才能观察到。
微生物主要分为以下几类：
1.原核微生物
细菌(Bacteria)
放线菌
螺旋体
支原体
立克次氏体
衣原体
古菌(Archaea)
2.真核微生物
真菌(Fungi)
原生生物(protozoan)
藻类(algae)
3.无细胞生物
病毒(virus)
类病毒(virusoid)
拟病毒(viroid)
朊毒体（亦称朊病毒、蛋白质质感染性颗粒）(prion)
特性
由于微生物体积极之微小，故相对面积较大，物质吸收快，转化快。
微生物在生长与繁殖上亦是很迅速的，而且适应性强。从寒冷的冰川到极酷热的温泉，从极高的山顶到极深的海底，微生物都能够生存。
由于微生物适应性强，又容易在较短时间内积聚非常多的个体（例如10^10个/毫升的数量级），因此容易筛选并分离到突变株。容易得到微生物突变株的性质。
微生物的五大共性:
体积小,面积大。
吸收多,转化快。
生长旺,繁殖快。
适应强,易变异。
分布广,种类多。
