区别有：
1、原料不同
（1）胡椒：由热带植物胡椒树的果实碾压而成，分白胡椒粉和黑胡椒粉两种，白胡椒粉为成熟的果实脱去果皮的种子加工而成，色灰白，种仁饱满，气味较浓，品质较好；黑胡椒粉是未成熟而晒干的实加工而成，果皮皱而黑，气味较淡。
（2）孜然：主要由安息茴香（即孜然）与八角、桂皮等香料一起调配磨制而成的。
2、作用功效不同
（1）胡椒：可药、食两用，中医学称胡椒有温胃散寒之功能。食法主要有直接食用胡椒粉。胡椒又是世界上主要调味香料，果实中含有挥发性油1-2%，胡椒碱8-9%，还含有粗脂肪、蛋白质、淀粉、可溶性氮等物质。
（2）孜然：孜然粉口感风味极为独特，富有油性，气味芳香而浓烈。它主要用于调味，是烧、烤食品必用的上等佐料，同时也是配制咖喱粉的主要原料之一。
