硒的化合物分为无机硒和有机硒两类，无机硒亚硒酸钠、硒酸钠的水溶液能被微生物和植物吸收。经微生物和植物吸收的硒，其中有一部分能与这些生物的氨基酸或蛋白质相结合，形成硒蛋氨酸、硒半胱氨酸或含硒酶等多种有机化合物，成为有机硒。它们是生物体的一部分，参加新陈代谢，维持生命活动。无机硒和有机硒都能被生物体吸收利用。有机硒吸收慢、利用率高。硒可以分为以下三类：
无机硒
无机硒属于工业用硒，是被国际明令禁止（用于食用和医疗的）。无机硒对人体伤害极大，无机硒有较大的毒性，且不易被吸收，不适合人和动物使用。
有机硒
有机硒一般以硒蛋氨酸形式存在，依循蛋氨酸代谢途径代谢，参与蛋白的合成，在组织内储存、吸收；被人体吸收被人体利用，有效改善人体内血硒状况。但有机硒的吸收率不完全，而且不易排出体内。现在一些补硒食品大多都是有机硒。
植物活性硒
植物活性硒是指农作物从经过富硒技术改良的土壤中吸收硒元素，经光合作用和农作物体内生物转化作用，在农作物体内以硒代氨基酸形态存在。它是传统农业和现代生物强化技术的结晶，农作物从富硒元素的土壤中通过纳米根部吸收技术，将硒吸收到体内，经过农作物的整个生长过程，通过光合作用和农作物自身的生物转化作用，将矿物质和有机状态的硒元素，转化成易于人体吸收和代谢的硒代蛋氨酸等。因此我们说植物活性硒，是更易于人体吸收的。植物活性硒被人体吸收率高达99%以上，同时也解决了代谢率低的问题，植物活性硒与人体重金属和有毒有机化合物结合，并将有害物质通过人体代谢通道如：汗液、呼吸、排泄等排出体外，从而对人体健康起到保护作用。
现在市面上销售的富硒产品中，作为营养强剂的硒元素，基本上都是酵母硒，甚至是采用亚硒酸钠。酵母硒是无机硒富集在生长酵母的细胞蛋白结构内生产的。酵母硒虽然很大成分上实现了无机硒向有机硒的转化，但转化率不高，还不能完全实现硒元素对人体的有益作用。亚硒酸钠则更不用说了，本身就是工业无机硒，具有一定的毒性。医学上用的亚硒酸钠药片，也需要根据医生的要求服用，不能天天食用。而动物和植物中的有机硒是经过植物的光合作用或动物的消费吸收，充分将土壤里的无机硒或人工施用的含有硒元素肥料或饲料中的无机硒转化为有机硒，这些经过生物转化而形成的有机硒可以被人体吸收利用，人们食用之后，对身体很有益处。
