双子叶植物与单子叶植物，两者的根系及根结构都有不同。
双子叶植物常为直根系，主根发达，主侧根明显，直根系入土深具有深根性。根有形成层，能进行次生生长，所以能增粗。
单子叶植物常为须根系：主根不明显，根系成丛生状，须根系入土浅具有浅根性。根无形成层，不能进行次生生长，所以增粗有限。
在初生根方面，二者共同点为：均由表皮、皮层和维管柱三部分组成；成熟区表皮具根毛，皮层有外皮层和内皮层，维管柱有中柱鞘；初生维管组织的发育顺序、排列方式相同。不同点是：
1）表皮层：在暴露于地面部分,有可能在外壁发生角质化,甚至引起整个细胞壁的木栓化或木质化。
2）皮层：单子叶外皮层除薄壁细胞外，偶有木质纤维。
单子叶内皮层除靠近导管的通过细胞外，其余细胞不仅半径向侧壁木栓化或木质化，而且切线向内侧壁，甚至整个细胞壁皆木栓化或木质化增厚。
3）中柱：单子叶织物初生木质部起源较多，常达8～30余出，髓部极其发达明显。中柱鞘及其内的一切薄壁组织都没有恢复分生能力，不能转化成为形成层。
