案件正卷和副卷是司法文书和材料的两种不同分类方式，其主要区别在于存放的内容和作用不同。
案件正卷是指法院、检察院在办理案件过程中所形成的一系列重要文件和材料的集合，包括起诉书、判决书、裁定书、证据材料、调查笔录、鉴定意见等，它是审判程序的重要组成部分，具有法律效力，作为法官审理案件的重要参考资料。一般情况下，正卷由法院或检察院负责管理和保存。
副卷是指正卷以外的案件材料的集合，主要包括与案件相关的卷宗、备忘录、侦查笔录、询问笔录、证人证言等。它的作用相对较小，一般用于辅助法官或检察官办案，作为查阅和参考资料，但其内容也应保密，需要严格管理和保存。
总的来说，正卷和副卷都是案件材料的分类方式，它们在内容和作用上有所不同，但都是司法机关办案的重要组成部分，需要严格管理和保存。
