浮游生物
由细菌、原生动物、腔肠动物、甲壳动物、毛颚动物等的一些种类组成，种类和生物数量均较少。生物数量通常随水深增加而明显降低。太平洋千岛-堪察加水域的中型浮游生物量，在200～400米水深处每立方米平均超过100毫克，但3000米以下却不到1毫克。同一种浮游动物，个体小时多生活在浅处，个体较大时生活在深处。如桡足类的海羽水蚤属和光水蚤属的一些种类，生活在2000米水深处个体最大可达17毫米，而随着水深变浅，个体大小也随之变小。深海浮游动物多为杂食或肉食性。浮游动物的垂直移动对营养物质的垂直转送起着积极的作用。
游泳生物
在深海也有不少鳗鱼，如哈氏囊咽鱼和宽咽鱼等。鱼体细长，嘴特别大。有些鳗鱼幼体上游到较浅的水层，成体时才回到深水。
在深海鱼类中，圆罩鱼属的个体数量最多，鱼的个体小，长仅5～6厘米，头大，暗褐色，其鳃可滤食浮游动物。不成群，个体之间约保持3米的距离。
底栖生物
深海底栖生物的生物量随水深而降低。在水深2000～3000米处底栖生物种类多。随水深的增加，其组成也发生变化，浅水种逐渐被深水种取代，通常200、3000和6000米处是转折点。在万米以上的深渊，仍有底栖生物，已发现的种类有：有孔虫、海葵、多毛类、等足类、端足类、瓣鳃类和海参类等。
