大雄宝殿位于虎丘五十三参之上，其址初为云岩禅寺的三山门，后毁于火。
明永乐十九年（1421），指挥童福海建为天王殿。宣德八年（1433），寺舍再次失火，包括天王殿被焚毁。万历四十六年(1618)至天启二年（1622），住持正元募材鸠工，重建天王殿。清代时，殿内曾悬康熙赐匾“香界连云”。咸丰年间，殿又毁于太平天国祸乱。
清同治十年（1871），由郡人陈德基在原天王殿旧址上建起大雄宝殿。殿内供奉如来佛像，上悬陆润庠所书“我佛慈悲”匾。
1966年，大殿恢复供奉佛像。文革中，佛像、匾额均毁。
1980年，再次恢复供奉释迦牟尼佛和迦叶尊者、阿难尊者塑像。1995年3月，对佛像进行整修装金，共用金箔3000张，同时重雕了佛像下面的莲花座。大殿两侧厢房，用为工艺品商店。
2012年，大雄宝殿再次大修，撤出商店。
2014年元旦，重新对外开放。
