处理沉放管段基础的目的是使沟槽底面平整，而不是为了提高地基的承载力。
在水下开挖的沟槽，其底面凹凸不平，如不加以整平，管段沉放后会因地基受力不均匀而导致局部破坏，或因不均匀沉陷而开裂。
为了提高沟槽底面的平整性，至今绝大多数建成的水底隧道采用垫平的方法。
早期大多采用一种在管段沉放之前先铺砂石作为垫层的先铺法。它是在作业船上通过卷扬机和钢索操纵特制的刮铺机或钢犁，沿着沟槽底面两侧设置的、具有规定标高和坡度的导轨，将放下的垫料往复刮平。
该法缺点较多。
另一种垫平的方法为后填法。即先将管段沉放在沟槽底上的临时支座上，并使管底形成一定的空间（管段底板内预设液压千斤顶，在定位时可以顶向支座，调节管段高程），随后用垫层材料充填密实。
后填法中最早用的是灌砂法，仅适用于底宽不大的船台型管段。
40年代初创造成功的喷砂法，适用于宽度较大的大型管段。
从水面上用砂泵将砂水混合料通过伸入管段底下的喷管向管底空间喷注，使形成一厚实均匀的砂垫层，喷砂作业须设专用台架和一套喷砂与回吸用的 L形钢管。
喷砂开始前，可利用它清除沟槽底上回淤土或塌方土。
喷砂完毕，随即松开定位千斤顶，利用管段重量将砂垫层压实。
这一基础处理方法在欧洲用之较多。沉管法70年代日本用沉管法建造东京港、衣浦港等水底隧道时，采用了压浆法、压混凝土法等管段基础处理的新技术。
