闽江是福建省最大的河流，是温水性鱼类栖息、生长、繁衍的良好场所，也是中华鲟、花鳗鲡等国家一二级保护水生野生动物的生长和产卵洄游场所。
据记载，闽江有以下鱼类:
（1）国家一级保护鱼:中华鲟和鲥鱼；
（2）国家二级保护鱼:花鳗鲡、胭脂鱼、唐鱼、鯮、长薄鳅和斑鳠；
（3）地方特有种有11种:短头鳗鲡、乌耳鳗鲡、福州鳗鲡、长汀拟腹吸鳅、圆斑拟腹吸鳅、九龙江拟腹吸鳅、拟腹吸鳅、裸腹原缨口鳅、花尾缨口鳅、缨口鳅、闽江扁尾薄鳅；
（4）有经济价值较高或产量较大的捕捞种类近80种:如鲟鱼、鲥鱼、鲚、香鱼、银鱼、鳗鲡、胭脂鱼、鳡鱼、鳈鱼、鳤鱼、红鲌鱼、鲌鱼、倒刺鲃、鱲、马口鱼、华鳊、花、蛇鮈、似鮈、厚唇鱼、铲颔鱼、白甲鱼、纹唇鱼、鲶鱼、黄颡类、鮠类、鳜类、斑鳢和月鳢等。
但在2006年，受水电站建设、河道改造、渔业捕捞等多方面因素的影响，闽江流域已出现鱼类种类数量下降、鱼类资源量下降等现象。
闽江的39种主要经济鱼类已绝迹的有2种，近于绝迹的有8种。所以保护闽江刻不容缓！
