恩施自治州地处我国第二阶梯东缘，属云贵高原东部延伸部分；境内有四大山脉，即武陵山脉、巫山山脉、大娄山山脉、大巴山山脉。
州内最高海拔3032米，平均海拔1000米以上。海拔1200米以上的高山地区占29.4％，800-1200米的二高山地区占43.6%，800米以下的低山地区占27.0％。
境内陆表切割深，沟壑纵横，地形地貌复杂，大河、小溪成树枝状展布。深谷，伏流、溶洞、冲、槽、漏斗、石林等常见。整个地势西北、东北部高，中部相对较低，阶梯状地貌发育。除东北部有海拔3000米以上山地外，普遍展布着海拔2000-1700米、1500-1300米、1200-1000米、900-800米、700-500米等5级面积不等的夷平面，并存在1-3级河谷阶地，呈明显层状地貌。河流切割明显，长江横贯巴东，切割穿巫山形成雄壮的巫峡。
清江、酉水、娄水、唐崖河、郁江等河流及其支流，多沿断裂发育，形成程度不等的深切曲流。
