1.科属不同
花骨鱼属于硬骨鱼纲、鲷科、辐鳍亚纲䱻属。
鳟鱼属辐鳍鱼纲、鲑科、鲑亚科鲑形目。
2.形态特征不同
花骨鱼俗称马驹子、卢季、季鱼、季郎鱼、鸡骨郎。体长，背鳍起点显著隆起。腹部圆，体侧和背部青褐色， 腹部白色，体侧中轴有数量不等的黑斑块，吻圆钝，口下位呈马蹄形， 口角有须一对，眼突出。
鳟鱼体长，略呈圆筒状，后段稍侧扁，腹部圆。体长约30厘米。头呈圆锥形，吻钝。口端位，口裂突，呈弧形。唇厚，上颌两侧有2对不明显的短须。下咽齿3行，顶端钩状。眼大。体背深黑色，腹部浅黄，体侧及背部鳞片基部各有一黑色的斑块，组成体侧的纵列条纹，眼上半部有一块红斑。背鳍深灰色，尾鳍后缘呈黑色，其他各鳍灰白。
3.生活习性不同
花骨鱼属于底层鱼类，喜在水体的中下层，冬季洄游至江河深水处越冬。以底栖动物为食，以水生昆虫，软体动物为主， 也食各种小鱼。最大个体可达2公斤。
鳟鱼是冷水性鱼类，生存临界水温0～24℃，最适生存水温16～18℃。主要摄食鱼类、甲壳类、底栖动物、水生昆虫等，亦吞食少量水生植物的枝叶、种子等。鳟鱼是中层性鱼类，一般情况下都在水体中层活动，但季候变化、水温冷暖、气压高低、风力风向、水位涨落、水体溶氧、饵物环境等因素随时都可能改变鳟鱼的栖息水层。
4.分布范围不同
花骨鱼主要分布于长江流域的江河、湖泊、水库中。
鳟鱼栖息于江河流速较缓的水域或湖泊。北起黑龙江，南至广东，西自四川，东到江浙一带的江河与湖泊，均有分布。
