嫩江水域中的鱼类又分两个群体：
一是小型成鱼群体。主要有银鲴、细鳞斜颌鲴、鮀鮈、湖鳜等。二是大型成鱼群体。主要有鲤、草、鲢、鳙、鲫、松花江翘嘴红鮊、蒙古红鮊以及冷水性的细鳞、乌苏里鲑等。
湖泊水域鱼类群体中，土著鱼种占主要部分，存活蓄殖量较多的有鲤、鲶、鳅、湖鲑等;人工养殖的主要有鲤、草、鲢、鳙、鲫等。
特别是久负盛名的三花五罗，即花魚骨、鳌花、鳊花;法罗、魱罗、鲖罗、雅罗、哲罗，更是嫩江的独有特产。其它许多名贵鱼种，就连黑龙江地区其它自然水域及其少见的甲鱼，嫩江里也有相当数量的种群存活。
此外，有些鱼类如草、青、鲢、鳙、鲂等，由于季节、水域的变化和天然饵料等原因，经常洄游在江河水域中繁殖或生活。
嫩江自然存活蓄殖淡水鱼类明细如下：
一、七鳃鳗科：日本七鳃鳗鱼，俗称七星鱼;
二、鲑科：哲罗，五罗之一;细鳞、乌苏里白鲑，俗称雅巴沙;
三、狗鱼科：狗鱼;
四、鲤科：雅罗，俗称华子鱼，五罗之一;青鱼，俗称青根;草鱼，也叫鲩鱼，俗称草根;湖鲑，俗称柳根;东北湖鲑，俗称柳根;拟赤梢鱼，俗称红尾巴梢;赤眼鱼、罗汉鱼，俗称麦穗鱼;鮀鮈，俗称船钉子、川丁子、船蜓子、沙锥;
银鲴，俗称黄姑子;细鳞斜颌鲴，俗称白鱼;鱤鱼，俗称鱤条;黑龙江乌口、唇魚骨、花魚骨，俗称吉勾鱼，三花之一;东北鰁、棒花、东北黑鳍鰁、三角鲂，俗称法罗，五罗之一;红鳍鲌、蒙古红鲌、松花江翘嘴红鲌，俗称噘嘴倒子;黑龙江鲂鮍，俗称葫芦子;兴凯刺鲂鮍，俗称葫芦子，五罗之一;黑龙江鲤、银鲫，也叫鲋鱼，俗称鲫瓜子;鲢，也叫鱮魚，俗称白鲢;鳙，俗称胖头鱼;团头鲂、长春鳊，俗称鳊花，三花之一;红鲤、镜鲤;
五、鳅科：泥鳅、花鳅、东北鲌鳅;
六、鮠科：黄颡，俗称嘎牙子;乌苏里鲍，俗称牛尾巴囊;
七、鲶科：鲶、六须鲶;
八、鳉科：育鳉;
九、鮨科：鳜，俗称鳌花，三花之一;
十、塘鳢科：葛氏鲈塘鳢，俗称老头鱼;
十一、鳢科：乌鳢，俗称黑鱼、鲖罗，五罗之一;
十二、鳕科：江鳕。
