长江流域1956〜2000年平均水资源总量为9958亿m3,占全国水资源总量的35%,其中地表水资源量为9856亿m3,占全国地表水资源量的36%,居全国十大区地表水资源量之首。1998年长江发生了20世纪第一位大洪水,该年长江流域水资源量为13004亿m3,占全国地表水资源量32726亿m3的40%。相应径流深为552.9mm,径流深次于东南诸河、珠江和西南诸河,居第四位。长江流域多年平均年地下水资源量为2492亿m3,占全国地下水资源量的30.3%。
其中,山丘区年均地下水资源量为2255.8亿m3,占长江流域地下水资源量的90.5%;平原区年均地下水资源量为247.6亿m3,扣除平原区与山丘区之间的重复计算量年均11.4亿m3后,占长江流域地下水资源量的9.5%。地下水资源量与地表水资源量的不重复计算水量约102.3亿mS占水资源总量的1%。