锡林郭勒职业学院有医学系、机械与电力工程系、草原生态与畜牧兽医系、师范教育系、信息技术工程系、经济管理系、蒙古语言文化与艺术系、体育系、齐·宝力高国际马头琴学院等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。
医学系
机械与电力工程系
草原生态与畜牧兽医系
师范教育系
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