经双方协商一致修改过的合同有效。依据我国相关法律的规定，合同生效后擅自修改条款的，修改的行为是无效的，但如当事人协商一致的，修改的行为是有效的。
《中华人民共和国民法典》第五百零九条当事人应当按照约定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。当事人在履行合同过程中，应当避免浪费资源、污染环境和破坏生态。
《中华人民共和国民法典》第五百四十三条当事人协商一致，可以变更合同。
《中华人民共和国民法典》第五百四十四条当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
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