公司变更法人后公司章程的修改流程：
1、由公司董事会修改公司章程的决议提出章程修改草案；
2、股东会对章程修改条款进行表决；
3、公司章程的修改涉及需要审批的事项时，报政府主管机关批准；
4、政府主管机关批准后，公司就变更事项进行公告。
《公司法》第四十三条
股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。
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