合伙合同纠纷涉及违法项目法院不会处理，因为法院的任务主要是负责审理民事、刑事和行政案件，通过审理活动解决民商事纠纷，如果法院审理过程中发现涉及到违法项目的，会把这些违法材料移交到相应的管理部门。
《民事诉讼法》第一百二十二条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
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