合作社注销的流程：首先向登记机关提出注销申请，然后进行债权债务清算，注销税务，社保、统计等单位账号；第三步是准备相关注销登记材料，并在规定时间内前往登记机关办理注销手续，最后当合作社清算完结，法人资格消灭，合作社依法被注销。需要的文件是成员大会、成员代表大会或者人民法院确认的清算报告；营业执照等。
《市场主体登记管理条例》第三十一条
市场主体因解散、被宣告破产或者其他法定事由需要终止的，应当依法向登记机关申请注销登记。经登记机关注销登记，市场主体终止。
市场主体注销依法须经批准的，应当经批准后向登记机关申请注销登记。
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