营业执照注销后烟草证会作废。法律规定，如果个体工商户有注销工商登记的行为，并在注销后半年内未开展经营活动，那烟草专卖局就会依法收回其烟草专卖许可证。公民、法人或者其他组织在取得烟草专卖许可证满半年后，尚未进行生产经营活动的，视同歇业，烟草专卖局在此时也会将烟草专卖许可证予以收回。
《烟草专卖许可证管理办法》第五十条取得烟草专卖许可证的公民、法人或者其他组织停止经营业务六个月以上不办理停业手续的，经发证机关公告一个月后仍未办理手续的，由发证机关收回烟草专卖许可证。
《烟草专卖许可证管理办法》第五十一条取得烟草专卖许可证的公民、法人或者其他组织在领取烟草专卖许可证后满六个月尚未开展生产经营活动的，视同歇业。烟草专卖局应当收回其烟草专卖许可证。
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