合同有霸王条款的处罚是：责令当事人对不公平的霸王条款进行改正，视情节轻重给予警告，处违法所得额三倍以下最高不超过三万元的罚款，没有违法所得的处一万元以下罚款。
《《合同违法行为监督处理办法》》第十二条当事人违反本办法第六条、第七条、第八条、第九条、第十条、第十一条规定，法律法规已有规定的，从其规定；法律法规没有规定的，工商行政管理机关视其情节轻重，分别给予警告，处以违法所得额三倍以下，但最高不超过三万元的罚款，没有违法所得的，处以一万元以下的罚款。
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