公司的保密协议一般不是霸王条款。保密协议一般包括保密内容、责任主体、保密期限、保密义务和违约责任，合同订立时双方具有保密义务，保密协议依法成立即生效。
《民法典》第五百零九条
当事人应当按照约定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。当事人在履行合同过程中，应当避免浪费资源、污染环境和破坏生态。
第五百七十七条
当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
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