公司恶意拖欠货物的款项，债权人可以起诉该公司请求偿还债务。根据相关法律规定，可以向法院申请支付令促使该公司还款，还可以向人民法院申请破产，只需要提供债务人到期未清偿的证据即可。
《民事诉讼法》第二百四十三条
发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。
调解书和其他应当由人民法院执行的法律文书，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。
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