抵押权被撤销抵押合同有效,一般不影响抵押合同的效力。抵押合同自成立之日起生效,抵押主体适格且意思表示真实、标的确定与可能、不违反法律或社会公共利益抵押合同即有效。
《《城市房地产抵押管理办法》》第三十四条以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的,登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后,由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。以预售商品房或者在建工程抵押的,登记机关应当在抵押合同上作记载。抵押的房地产在抵押期间竣工的,当事人应当在抵押人领取房地产权属证书后,重新办理房地产抵押登记。