公司拖欠三个月工资可以直接离职的，因为按时发放工资是用人单位的义务。根据相关法律规定，劳动者首先应当进行劳动仲裁，若是对于仲裁结果不服的，才能诉讼。
《劳动合同法》第三十七条
劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
第三十六条
用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
第三十八条
用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：
（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的。
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