公司合同纠纷管辖法院可以由合同约定，若是没有约定的，由被告的住所地管辖以及合同履行地法院管辖。根据相关法律规定，一般案件应当适用基层法院管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十三条因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十四条因保险合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者保险标的物所在地人民法院管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十五条因票据纠纷提起的诉讼，由票据支付地或者被告住所地人民法院管辖。
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