对股东表决权进行限制的方式主要是通过公司章程限制，比如不按照出资比例进行表决，而是按照人头数进行表决。根据相关法律规定，股份公司必须按照持股比例进行表决。
《公司法》第四十三条
股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。
第四十二条
股东会会议由股东按照出资比例行使表决权；但是，公司章程另有规定的除外。
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