企业纳税申报方式有直接申报，就是携带材料到税务大厅进行申报，邮寄申报，还有通过数据电文进行申报。根据相关法律规定，数据电文申报更能提高双方的效力。
《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第三十条税务机关应当建立、健全纳税人自行申报纳税制度。纳税人、扣缴义务人可以采取邮寄、数据电文方式办理纳税申报或者报送代扣代缴、代收代缴税款报告表。
数据电文方式，是指税务机关确定的电话语音、电子数据交换和网络传输等电子方式。
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