未取得施工许可证擅自施工的，由相关部门处工程合同价款1%至2%的罚款。根据法律规定，建设单位未取得施工许可证擅自施工的，由相关部门责令改正，对不符合开工条件的，责令停止施工，可处罚款。
《建筑法》第六十四条违反本法规定，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，可以处以罚款。
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