个人独资企业由投资人对公司债务承担无限责任。根据我国相关法律规定，依照法律在中国境内设立，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。公司股东不能证明公司财产独立于自己财产的，承担无限责任。
《中华人民共和国个人独资企业法》第二条本法所称个人独资企业，是指依照本法在中国境内设立，由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。
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