处理股东权益纠纷的办法：若纠纷当事人能就纠纷达成协商的，一般可以由当事人协商处理。若当事人不能或不愿协商的，可以申请第三方调解，或根据仲裁约定申请仲裁，仍无法处理的，可提起诉讼。
《中华人民共和国民法典》第二百三十三条物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
《民事案件案由规定》二十一 与公司有关的纠纷
262.股东资格确认纠纷
263.股东名册记载纠纷
264.请求变更公司登记纠纷
265.股东出资纠纷
266.新增资本认购纠纷
267.股东知情权纠纷
268.请求公司收购股份纠纷
269.股权转让纠纷
270.公司决议纠纷
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