村镇房屋所有权是合法有效的。村镇房屋具有相应的产权证，能够证明房屋的所有权，其由国家建设部统一印制，是代表房产所有权的证书，因此村镇房屋所有权合法有效。
《中华人民共和国民法典》第二百零九条不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
《中华人民共和国民法典》第二百一十条不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。
国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。
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