有土地使用证拆迁院子的，补偿时应当将院子计算在内。但是如果院子是在没有取得相关批准的情况下建造的，在拆迁时已经被确认为违法建筑的，则对其不予补偿。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
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