有土地使用证却不能建房的原因：当事人没有向相关部门申请。并非有土地证就能建房，根据相关法律规定，当事人还需要到当地建管部门申请规划许可证和施工许可证，各证齐全后才能建房。
《中华人民共和国民法典》第三百六十二条宅基地使用权人依法对集体所有的土地享有占有和使用的权利，有权依法利用该土地建造住宅及其附属设施。
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