破产企业整顿的程序是：
1、债务人或者债权人依法提出重整申请；
2、债务人或者管理人制定重整计划草案，同时向人民法院和债权人会议提交；
3、重整计划经所有表决组通过后，由债务人负责执行。
《中华人民共和国企业破产法》第七十条债务人或者债权人可以依照本法规定，直接向人民法院申请对债务人进行重整。债权人申请对债务人进行破产清算的，在人民法院受理破产申请后、宣告债务人破产前，债务人或者出资额占债务人注册资本十分之一以上的出资人，可以向人民法院申请重整。
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