厂房部分承租部分自建的，承租部分由出租人和承租人按照合同约定或协商进行补偿，对自建部分的补偿包括：
1、自建部分房屋的价值补偿；
2、自建部分房屋内的搬迁、临时安置的补偿；
3、自建部分的停产停业损失的补偿。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
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