公司申请公租房的流程如下：
1、向住房保障主管部门提交申请材料；
2、住房保障主管部门应当会同有关部门对申请人提交的申请材料进行审核；
3、经公示无异议或者异议不成立的，登记为公共租赁住房轮候对象。
《公共租赁住房管理办法》第八条申请人应当根据市、县级人民政府住房保障主管部门的规定，提交申请材料，并对申请材料的真实性负责。申请人应当书面同意市、县级人民政府住房保障主管部门核实其申报信息。申请人提交的申请材料齐全的，市、县级人民政府住房保障主管部门应当受理，并向申请人出具书面凭证；申请材料不齐全的，应当一次性书面告知申请人需要补正的材料。对在开发区和园区集中建设面向用工单位或者园区就业人员配租的公共租赁住房，用人单位可以代表本单位职工申请。
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