土地纠纷最有利的证据有：
1、由政府颁发的确定土地权属的凭证；
2、人民政府或主管部门批准使用土地的相关文件；
3、发生纠纷的双方当事人依法达成的书面协议；
4、人民政府或司法机关处理纠纷的文件或附图；
5、其他相关的证明文件。
《土地权属争议调查处理办法》第二十条国土资源行政主管部门在调查处理争议案件时，应当审查双方当事人提供的下列证据材料：
（一）人民政府颁发的确定土地权属的凭证；
（二）人民政府或者主管部门批准征收、划拨、出让土地或者以其他方式批准使用土地的文件；
（三）争议双方当事人依法达成的书面协议；
（四）人民政府或者司法机关处理争议的文件或者附图；
（五）其他有关证明文件。
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