二手房商铺过户的费用是：
1、卖方包括5.5%的营业税、1%的个人所得税和3元每平方的土地交易服务费；
2、买方包括1%的契税、3元每平方的土地交易服务费以及每人50元的登记费。
《中华人民共和国民法典》第二百零九条不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
《中华人民共和国民法典》第二百一十条不动产登记，由不动产所在地的登记机构办理。
国家对不动产实行统一登记制度。统一登记的范围、登记机构和登记办法，由法律、行政法规规定。
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