办理相关审批手续属于合法建筑的小产权房被违规拆迁的政府一般有赔偿，反之没有，拆迁户在知道或者应该知道有关机关或者工作人员在行使权力侵害合法财产日起两年内可以申请赔偿。涉及到违法拆迁的，可以结合具体政策申请相应的赔偿。
《《国有土地上房屋征收与补偿条例》》第二十四条市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。
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