分公司申请注销的流程如下：
1、自分公司清算结束之日起30日内向原公司登记机关申请注销登记；
2、提交法律规定的文件；
3、持《分公司注销登记核准通知书》到公司登记机关撤销备案。
《中华人民共和国公司登记管理条例》第四十三条第一款
公司申请注销登记，应当提交下列文件：
（一）公司清算组负责人签署的注销登记申请书；
（二）人民法院的破产裁定、解散裁判文书，公司依照《公司法》作出的决议或者决定，行政机关责令关闭或者公司被撤销的文件；
（三）股东会、股东大会、一人有限责任公司的股东、外商投资的公司董事会或者人民法院、公司批准机关备案、确认的清算报告；
（四）《企业法人营业执照》；
（五）法律、行政法规规定应当提交的其他文件。
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