公司股权转让1年多未办理变更有效。股权转让协议，如果是双方当事人真实意思表示，且内容并未违反法律规定，即使没有办理变更登记，也是合法有效，双方当事人均应依约严格按照协议的内容履行。
《公司法》第七十三条
依照本法第七十一条、第七十二条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。
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