发票作废少一联，违规作废发票可能罚款2000以下，具体数额由税务局决定；符合正常的原因而作废的发票，和税务商量下写个证明，一般是不需要罚款的。
《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十四条税务机关对违反发票管理法规的行为进行处罚，应当将行政处罚决定书面通知当事人；对违反发票管理法规的案件，应当立案查处。
对违反发票管理法规的行政处罚，由县以上税务机关决定；罚款额在2000元以下的，可由税务所决定。
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