纳税人转让土地使用权应当向土地所在地的主管税务机关申报纳税。根据我国法律的规定，农民集体所有的土地的使用权一般不得出让、转让或者出租用于非农业建设。
《《中华人民共和国土地管理法》》第六十三条农民集体所有的土地的使用权不得出让、转让或者出租用于非农业建设；但是，符合土地利用总体规划并依法取得建设用地的企业，因破产、兼并等情形致使土地使用权依法发生转移的除外。
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